Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms