Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrfn4Q80XU8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms