Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SnupnQ80W37 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms