Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms