Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup214Q80U93 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms