Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Avl9Q80U56 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Avl9Q80U56 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms