Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul9Q80TT8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul9Q80TT8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms