Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atf7ipQ7TT18 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf7ipQ7TT18 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms