Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClmQ7TSN2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClmQ7TSN2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms