Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dsg1bQ7TSF1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg1bQ7TSF1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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