Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms