Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tnfsf18Q7TS55 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf18Q7TS55 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms