Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prrc2bQ7TPM1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms