Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Mycbp2Q7TPH6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms