Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD1

Fbxo11, F-box only protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo11Q7TPD1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fbxo11Q7TPD1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fbxo11Q7TPD1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms