Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stk40Q7TNL3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms