Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tigd3Q7TM95 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tigd3Q7TM95 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tigd3Q7TM95 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tigd3Q7TM95 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms