Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Vma21Q78T54 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vma21Q78T54 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vma21Q78T54 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vma21Q78T54 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vma21Q78T54 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vma21Q78T54 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vma21Q78T54 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Vma21Q78T54 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Vma21Q78T54 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Vma21Q78T54 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vma21Q78T54 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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