Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rph3alQ768S4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms