Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme8Q715T0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme8Q715T0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme8Q715T0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme8Q715T0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms