Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SynmQ70IV5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SynmQ70IV5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SynmQ70IV5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms