Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnih3Q6ZWS4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms