Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ift172Q6VH22 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ift172Q6VH22 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms