Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms