Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Timd4Q6U7R4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms