Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gja6Q6S5G4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja6Q6S5G4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms