Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms