Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf4Q6PFF0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms