Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd4Q6PDQ2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd4Q6PDQ2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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