Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms