Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms