Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhb9Q6PB60 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhb9Q6PB60 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms