Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Herc4Q6PAV2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Herc4Q6PAV2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms