Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2mQ6P6I6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms