Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nwd2Q6P5U7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms