Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2aQ6P4T0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms