Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slx4Q6P1D7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slx4Q6P1D7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms