Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrig3Q6P1C6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig3Q6P1C6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms