Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Szrd1Q6NXN1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms