Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms