Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdr44Q6NVE8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr44Q6NVE8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms