Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frem2Q6NVD0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms