Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mvb12bQ6KAU4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms