Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh1Q6IUP1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh1Q6IUP1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms