Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep78Q6IRU7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms