Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Krt40Q6IFX3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Krt40Q6IFX3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Krt40Q6IFX3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Krt40Q6IFX3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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