Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm5416Q6IE28 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm5416Q6IE28 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5416Q6IE28 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5416Q6IE28 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms