Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hecw2Q6I6G8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw2Q6I6G8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw2Q6I6G8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms