Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarca2Q6DIC0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms