Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Arhgef39Q66JY6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Arhgef39Q66JY6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Arhgef39Q66JY6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Arhgef39Q66JY6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgef39Q66JY6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Arhgef39Q66JY6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Arhgef39Q66JY6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Arhgef39Q66JY6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Arhgef39Q66JY6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Arhgef39Q66JY6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Arhgef39Q66JY6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Arhgef39Q66JY6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms